PENGEMBANGAN PENANDA MOLEKULER BERBASIS PCR SEBAGAI SISTEM DETEKSI DINI KEBERADAAN JAMUR PENYEBAB ANTHRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI

Jamsari , Jamsari and Reflin, Reflin (2007) PENGEMBANGAN PENANDA MOLEKULER BERBASIS PCR SEBAGAI SISTEM DETEKSI DINI KEBERADAAN JAMUR PENYEBAB ANTHRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI. Working Paper. Fakultas Pertanian. (Unpublished)

Microsoft Word (PENGEMBANGAN PENANDA MOLEKULER BERBASIS PCR SEBAGAI SISTEM DETEKSI DINI KEBERADAAN JAMUR PENYEBAB ANTHRAKNOSA PADA PERTANAMAN CABAI) - Supplemental Material Available under License Creative Commons Public Domain Dedication. Download (25Kb)

Abstract

Keberhasilan pengendalian dan penanganan penyakit anthraknosa pada tanaman cabai sangat ditentukan oleh kemampuan identifikasi dini keberadaan pathogen penyebabnya. Untuk tujuan tersebut telah dilakukan analisis finger printing berbasis RAPD terhadap 20 isolat jamur penyebab anthraknosa, sehingga diperoleh 4 primer yang memperlihatkan adanya fragmen spesifik pada spesies C. gleosporides, 3 primer pada C. capsici dan 1 primer ditemukan pada kedua species tersebut. Protokol Saghai – Maroof et al., (1994) dan protokol Kit dari Promega ternyata dapat digunakan untuk preparasi DNA spesies C. gleosporides dan C. Capsici, sdangkan material terbaik adalah miselia yang dihasilkan dari cultur cair berumur 2 hari. Dari 25 primer RAPD yang di uji, 80% mampu menghasilkan produk PCR yang dapat digunakan untuk analisis variabilitas diantara spesies C. capsici dan C. gleosporides. Dari 10 primer yang diuji, 4 primer memperlihatkan fragmen spesifik pada C. capsici, sedangkan 1 primer memperlihatkan fragmen umum untuk kedua spesies. Pengujian reamplifikasi bberapa fragmen RAPD spesifik yang telah di isolasi dan di purifikasi dari matrik agarnya memperlihatkan bukti yang beragam tentang spesifitas fragmen RAPD, yang terlihat dari terbentuknya beberapa fragmen dengan ukuran berbeda, sehingga perlu kehati – hatian dalam menggunakan fragmen ini untuk kegiatan sekuensi langsung

Actions (login required)

View Item